Situado sobre la principal avenida, al poniente de nuestra ciudad, las instalaciones de la Presidencia Municipal se encuentran en lo que fue el antiguo Convento Dominico, el cual forma parte del Catálogo Nacional de Bienes Inmuebles Históricos, Siglo XVII-XIX del Instituto Nacional de Antropología e Historia.
Derivado de las Leyes de Reforma, fue segregado del Templo de Santo Domingo en el último tercio del siglo XIX, época de la que data la actual fachada; de la anterior, solo queda el parámetro que da al atrio, del que se pueden apreciar algunos arcos del portal de peregrinos. En el patio están distribuidos los corredores donde actualmente se encuentran algunas oficinas de la administración municipal.
En el Archivo Histórico Municipal es donde se encuentra el documento que detalla datos interesantes a través del Fondo Documental Presidencia, 1869, y que fueron plasmados en un libro sobre “Sitios históricos y monumentos antiguos del municipio de San Juan del Río. Un acercamiento a los documentos del Archivo Histórico Municipal”, de la autoría de María del Mar Santana.
Este edificio ha sido lugar de importantes acontecimientos que forman parte de nuestra historia; ahí se encuentra el Salón de Cabildo, lugar donde se han llevado a cabo las reuniones de regidores y sesiones solemnes, hasta antes del cambio al edificio denominado Centro Cívico, en la actual administración municipal.
Las fotografías de quienes han sido presidentes municipales de esta tierra de palomas se encuentran en el Salón de Cabildo, lugar donde se sigue sesionando de manera solemne cada 24 de junio Día de San Juan, ceremonia que es encabezada por el presidente municipal y que se enmarca con la entrega de reconocimientos a sanjuanenses destacados y la cancelación del sello postal.