Fue la primera que se construyó en esta ciudad, tuvo primero por nombre “La Parroquia de los Naturales” posteriormente fue consagrada al Sagrado Corazón, por el P. Esteban García Rebollo, en el año 1877.

Ahora está dedicada a San Juan Bautista, patrono de esta ciudad de San Juan del Río, donde mañana tendrán lugar las misas en su honor, y principalmente la que el Obispo de Querétaro, don Faustino Armendáriz, celebrará a las 7 de la tarde.